Учёные создали первую полную атомную модель коронавируса нового типа
Это поможет разработать эффективную вакцину против CoViD-19.
Американские учёные создали первую версию полной трёхмерной модели коронавируса, для чего просчитали атомную структуру его оболочки с помощью суперкомпьютера. Статья опубликована в научном журнале ACS Central Science.
— Эти модели помогут нам понять, какие части коронавируса играют важную роль в том, как он проникает в клетки человека. Если мы раскроем эти секреты SARS-CoV-2, то у учёных будет больше шансов на создание новых лекарств от CoViD-19. Также они смогут понять, как работают уже существующие препараты, — рассказала одна из авторов работы Ромми Амаро.
Full length SARS-CoV-2 spike protein with glycans running in MD shows vastly altered accessibility for small molecules and antibodies (aka #glycotime for the #COVID19 #demogorgon) @LCasalino88 (movie) @zied_gaieb @abbydommer @AmaroLab pic.twitter.com/uNtLvYDCRn
— Rommie Amaro (@RommieAmaro) March 22, 2020
Ещё в середине февраля учёным удалось расшифровать точную трёхмерную структуру тех белков оболочки вируса, которые участвуют в заражении клетки. Как отмечает Амаро, это важная составляющая вируса, которая является лишь небольшой частью его белковой оболочки. А одиночная частица SARS-CoV-2, по подсчётам учёных, состоит примерно из двух сотен миллионов атомов. Поэтому вирус очень сложно изучать и с помощью ускорителя частиц, который делает снимки с атомным разрешением, и используя суперкомпьютеры, "сшивающие" полученные изображения в одно трёхмерное.
Кроме того, изображения всех компонентов оболочки вируса сделали в разных лабораториях с разным разрешением, поэтому учёным пришлось потратить много времени на объединение данных и подготовку первой полноценной модели, которую потом просчитали на суперкомпьютере Frontera.
Расчёты, по словам Амаро, начались около двух недель назад. А в ближайшее время учёные планируют получить полное трёхмерное изображение одиночной вирусной частицы и её устройства.